Karya kesehatan berada di bawah naungan Yayasan Pelayanan Kasih Agustinian (YPKA) yang bertujuan meningkatkan mutu dan derajat kesehatan masyarakat melalui pelayanan kesehatan secara prefentif dan kuratif, rehabilitasi sebagai wujud kehadiran Kerajaan Allah dalam hidup manusia. Karya kesehatan meliputi: Rumah Sakit Fatima-Ketapang, Rumah Sakit Sumber Sentosa Tumpang-Malang, Apotik Caritas-Ketapang, RB desideria-Sandai, BP/BKIA Ria Rantai 1-Menyumbung, BP/BKIA Mutiara-Tanjung, BP Batu Keling Tanjung, BP Pengatapan-Tumbang Titi, dan BP St. Monica-Manjau.